《科学》
储存哺乳动物细胞转录组的基因编码系统
美国博德研究所的陈飞（音）团队研究出一种在哺乳动物细胞中储存转录组的遗传编码系统。相关研究成果近日发表于《科学》。
要想了解细胞是如何随着时间推移做出决定的，需要将过去的分子状态与未来的表型结果联系起来。研究团队提出一个基因编码系统——TimeVault，它可以在活的哺乳动物细胞中记录和存储转录组，以备未来读取。
TimeVault利用工程库颗粒，通过聚（A）结合蛋白捕获mRNA。研究团队证明，TimeVault储存的转录组在活细胞中可稳定存在超7天，它能以最小的细胞扰动进行高保真转录组全范围记录，捕捉瞬时应激反应，并揭示逃避表皮生长因子受体（EGFR）抑制的肺癌细胞中药物初始状态下的基因表达变化。通过连接过去和现在的细胞状态，TimeVault成为解码细胞如何应对压力的反应、做出命运决定和抵抗治疗的强大工具。
相关论文信息：
https://doi.org/10.1126/science.adz9353
古地理调节显生宙海洋灭绝风险
英国牛津大学的Erin E. Saupe团队揭示了古地理能够调节整个显生宙的海洋灭绝风险。相关研究成果近日发表于《科学》。
解析地球历史上影响物种灭绝强度与选择性的因素，对解释过去生物多样性的变化、预测生物对环境变化的响应至关重要。
研究团队探讨了过去5.4亿年内海岸线几何构型与古地理边界条件对浅海类群灭绝风险的影响。研究表明，类群的地理分布与大陆边缘几何构型之间的相互作用能用于持续预测相对灭绝风险。潜在扩散路径长度相对于跨越纬度范围较大的类群，如沿东西向海岸线、岛屿或内陆海道分布的类群，其灭绝风险始终高于那些具有更直接跨纬度扩散路径的类群。这种扩散距离选择性在物种大灭绝事件和极端升温期尤为显著，表明地理限制在气候剧变时期的影响更为突出。
该研究揭示了古生代灭绝率普遍偏高的另一种潜在机制。该时期以复杂的内陆海域和占主导地位的东西向海岸线为特征。这些发现强调了解读历史灭绝模式时考虑古地理背景的重要性，并为现有物种灭绝风险评估的基本假设提供了实证支持。
相关论文信息：
https://doi.org/10.1126/science.adv2627
《自然》
小鼠疾病耐受性和感染发病机制与年龄相关的变化
美国索尔克生物研究所的Janelle S. Ayres团队提出了小鼠疾病耐受性和感染发病机制与年龄相关的变化。相关研究成果近日发表于《自然》。
疾病耐受性是感染后存活必需的防御策略，它能够在不杀死病原体的情况下限制生理损伤。由于随着年龄增长而积累的结构和功能生理变化，感染可能导致的疾病的性质和病理在宿主一生中会发生变化。成功的疾病耐受性反应需要宿主参与与疾病本身和感染引起的病理相兼容的机制，研究人员预测这种防御策略会随着年龄的增长而改变。由于疾病耐受性存在差异，感染半数致死量病原体的动物通常表现出不同的健康和疾病轨迹，可以用来定义耐受机制。
在多微生物脓毒症模型中，研究团队发现，在感染半数致死量病原体的情况下，老年易感小鼠和年轻易感小鼠表现出不同的疾病症状。在年轻幸存小鼠中，心脏部位的转录因子Foxo1及其下游效应物Trim63（MuRF1）能够保护机体免受败血症引起的心脏重塑、多器官损伤和死亡。相反，在老年小鼠中，Foxo1和Trim63却成为败血症发病和死亡的驱动因素。该发现对根据感染个体的年龄定制治疗具有启示意义，表明疾病耐受基因具有拮抗多效性。
相关论文信息：
https://doi.org/10.1038/s41586-025-09923-x
《免疫》
共生海藻糖引发保护性眼屏障免疫
美国国立卫生研究院的Rachel R. Caspi团队发现共生海藻糖引发了γδ T细胞驱动的保护性眼屏障免疫。相关研究成果近日发表于《免疫》。
研究团队发现，乳腺炎棒状杆菌中的海藻糖单根藓酸盐（TMCM）是眼表Vγ4 γδ T细胞产生白细胞介素-17（IL-17）的有效刺激物。在机制上，TMCM诱导的IL-17反应依赖于白细胞介素-1（IL-1R）和γδ T细胞受体（TCR）信号传导，TCR参与了IL-1R在γδ T细胞上表达的进一步增强。单独合成的TMCM重现了乳腺炎棒状杆菌在眼表激发保护性γδ T细胞免疫以预防细菌感染中的作用。
此外，TMCM还能促进下游眼部组织和皮肤的保护性免疫。这些发现明确了TMCM是一种广泛适用的共体驱动免疫防御介质，并强调了其在加强IL-17介导的屏障部位保护方面的治疗潜力。
研究人员表示，微生物通过与宿主受体的分子串扰塑造宿主生理机制，因此识别影响宿主免疫的特定微生物因子是了解宿主-微生物界面稳态和推进微生物治疗的关键。
相关论文信息：
https://doi.org/10.1016/j.immuni.2025.12.007
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